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1. 自适应球形演化的药物-靶标相互作用预测方法
刘一迪, 温自豪, 任富香, 李诗音, 唐德玉
《计算机应用》唯一官方网站    2024, 44 (3): 989-994.   DOI: 10.11772/j.issn.1001-9081.2023070929
摘要98)   HTML2)    PDF (757KB)(64)    收藏

相较于传统药物的研发,药物-靶标的预测方法能够有效降低成本,加快研发进程,但是在实际应用中存在数据集平衡度低、预测精确率不高等问题。基于此,提出一种自适应球形演化的药物-靶标相互作用预测方法ASE-KELM(self-Adaptive Spherical Evolution based on Kernel Extreme Learning Machine)。该方法根据结构相似的药物与靶标更易存在相互作用的原理筛选出高置信度的负样本;并且为了解决球形演化算法易陷入局部最优的问题,利用搜索因子历史记忆的反馈机制及群大小线性递减的策略(LPSR),实现全局搜索和局部搜索的平衡,提高算法的寻优能力;然后利用自适应球形演化算法对核极限学习机(KELM)的参数进行优化。在基于黄金标准的数据集上将ASE-KELM与NetLapRLS(Network Laplacian Regularized Least Square)、BLM-NII(Bipartite Local Model with Neighbor-based Interaction profile Inferring)等算法进行对比,验证算法的性能。实验结果表明,在酶(E)、G-蛋白偶联受体(GPCR)、离子通道(IC)和核受体(NR)数据集中,ASE-KELM的ROC曲线下面积(AUC)与PR曲线下面积(AUPR)均优于对比算法;且基于DrugBank等数据库,ASE-KELM在预测新药物-靶标对的验证过程中表现良好。

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2. 基于全卷积网络和条件随机场的宫颈癌细胞学图像的细胞核分割
刘一鸣, 张鹏程, 刘祎, 桂志国
计算机应用    2018, 38 (11): 3348-3354.   DOI: 10.11772/j.issn.1001-9081.2018050988
摘要1010)      PDF (1095KB)(830)    收藏
针对宫颈癌细胞学筛查中由于宫颈细胞核形状复杂多样等因素而导致分割不够精确的问题,提出了一种结合了全卷积网络(FCN)和全连接条件随机场(CRF)的细胞核分割方法。首先,根据Herlev数据集的特点搭建微型全卷积网络(T-FCN),利用细胞核区域像素级别的类别先验信息,自主学习多层次特征来获取细胞核的粗分割结果;然后,通过最小化包含有整幅细胞图像中所有像素类别、像素色彩值与位置等信息的全连接CRF的能量函数来剔除粗分割结果中微小的误分割,并细化分割边缘。在Herlev数据集上的实验结果显示,提出的方法在查准率(Precision)、查全率(Recall)与Zijdenbos相似性指数(ZSI)上均有高于0.9的表现,表明得到的细胞核分割结果与其真实轮廓高度匹配,分割精确。相较于传统方法中对异常细胞核的分割精度较正常细胞核低的情况,提出的方法在异常细胞核的分割指标上普遍优于正常细胞核。
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3. 基于轨道约束的空间目标球面网格索引及区域查询应用
吕亮, 施群山, 蓝朝桢, 陈宇, 刘一萍, 梁静
计算机应用    2017, 37 (7): 2095-2099.   DOI: 10.11772/j.issn.1001-9081.2017.07.2095
摘要468)      PDF (768KB)(337)    收藏
针对海量、高速运动的空间目标检索查询效率低的问题,提出一种基于轨道约束的空间目标球面网格索引构建方法。该方法利用地球惯性系下空间目标轨道相对稳定的特性,通过维护球面剖分网格内途经的空间目标列表,实现了对高速运动目标的稳定索引。在此基础上,提出基于目标球面网格索引的区域查询应用方案,首先,依据一定步长离散查询时段;然后,计算查询区域在惯性空间的边界点坐标并确定交叉网格;其次,提取网格中的空间目标,计算并判断目标与区域的位置关系;最后,递归查询整个时段,实现空间目标过境查询分析。仿真实验中,传统逐目标查询方法耗时与目标数量线性正相关而与区域大小无关,单目标平均耗时0.09 ms;与之相比,所提方法用时随区域面积减小呈线性递减,区域格网数小于2750时,时间效率高于对比方法,且能够维持相当的准确率。实验结果表明,该方法在实际区域应用中可以有效提升查询的效率。
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4. 基于可信计算的网络互联模型
刘一博 殷肖川 高培勇 张毅卜
计算机应用    2014, 34 (7): 1936-1940.   DOI: 10.11772/j.issn.1001-9081.2014.07.1936
摘要213)      PDF (767KB)(521)    收藏

针对传统互联技术难以实现内外网在安全可信情况下互联互通互操作的问题,将可信计算中的相关技术应用到网络互联中,实现内外网在安全隔离情况下的信息交互。研究了网络可信互联框架模型,结合该模型,对基于身份的公钥认证算法进行改进,设计了认证系统与接入者之间的密码协议。分析实体的持续性行为进行并建立评估树模型,对接入者自身的安全状况进行综合可信度评估。最后,通过测试实验对评估方法进行分析与验证,实验结果表明,该评估模型排除时效偏差等不利因素的影响,具有可行性和有效性。

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5. 基于再采样的图像重采样伪作检测
刘一 刘本永
计算机应用    2014, 34 (3): 815-819.   DOI: 10.11772/j.issn.1001-9081.2014.03.0815
摘要770)      PDF (771KB)(518)    收藏

重采样是图像篡改中的一种典型操作,针对现有重采样伪作检测算法对于JPEG压缩格式的图像检测效果不理想,也无法准确估计其中的缩放因子的问题,提出了基于再采样的图像重采样检测算法。该算法先将待检验的JPEG图像以缩放因子小于1进行再次重采样,以削弱JPEG压缩对算法的影响,再利用重采样信号二阶导数具有的周期性来进行重采样操作检测。实验结果表明,该算法具有很强的抗JPEG压缩能力,同时能够准确估计真实的缩放因子。另外,该算法对于经过不同缩放因子而得到的图像进行合成时的重采样操作,也有明显的检测效果。

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6. 智能体行动推理中的信念修正
刘一松 桑丘 刘朗宇
计算机应用    2010, 30 (07): 1892-1895.  
摘要970)      PDF (607KB)(1105)    收藏
信念修正中的加强修正算法在保留低秩非矛盾信念时存在不足,流演算由于其表示公式的局限,无法较好的与信念修正结合来进行行动推理。针对以上不足,提出了依赖信念修正算法和Strategy-Axiom-Reasoning模型。该算法满足Ind假设并且较好的保留了条件信念和低秩非矛盾信念,SAR模型继承并改进了流演算的公理系统,用公式集表示信念集,较好的实现了与信念修正的结合。最后将依赖信念修正算法运用到SAR模型中,用实验证明了其可行性。
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7. 安全协议认证属性的设计框架研究
刘一静 谢鸿波 吴远成
计算机应用   
摘要1429)      收藏
提出了一种安全协议的认证属性设计方法。该方法设计了协议认证消息结构,通过通道模型增加设计过程中消息结构的动态安全特性,采用迹模型准确描述消息交互过程。讨论了避免攻击的安全属性设计原则,并通过形式化的方法表示出来。最后证明了该形式化方法的有效性。
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